La CJL actúa desde un enfoque de Litigio Estratégico que ha sido objeto de una sistematización en el año 2015. Este enfoque se define como un ejercicio de defensa integral de los derechos humanos y de los pueblos que, mediante la integración y complementariedad de estrategias jurídicas, formativas, psicosociales, políticas y de incidencia, investigativas y comunicativas en torno a un caso o conjunto de casos de graves violaciones a los derechos humanos, busca generar precedentes jurídicos, políticos y sociales que promuevan cambios e impactos en la sociedad. Esto se traduce en la transformación de las conciencias, la superación de la impunidad, el restablecimiento de los derechos de las víctimas y la garantía integral de los derechos humanos. El litigio estratégico contempla el fortalecimiento de las personas y colectivos vulnerados para que se asuman como sujetos políticos y protagonistas de estas transformaciones.
Con lo anterior, desde el Área de Defensa del Territorio, se decide construir lineamientos en clave de litigio estratégico que permitan proponer rutas de incidencia social, política, jurídica y brindar herramientas para el desarrollo de procesos de exigibilidad de derechos. Así mismo, se busca fortalecer el quehacer de las organizaciones comunitarias y campesinas en la defensa del territorio y del ambiente.